Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF17Q9BXT8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms