Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG6Q9BXT2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms