Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms