Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms