Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms