Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms