Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms