Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms