Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBF4Q9BQW3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms