Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms