Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRBNQ96SW2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms