Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL15Q96M94 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL15Q96M94 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms