Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCZQ96LD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms