Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP47Q96K76 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms