Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRIQ1Q96JM4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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