Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms