Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms