Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms