Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HPS3Q969F9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms