Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP9XQ93008 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP9XQ93008 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP9XQ93008 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP9XQ93008 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP9XQ93008 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP9XQ93008 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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