Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL22A1Q8NFW1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms