Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms