Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms