Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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