Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms