Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms