Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC174Q6PII3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms