Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms