Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q6P435 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q6P435 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q6P435 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q6P435 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q6P435 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q6P435 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q6P435 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q6P435 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q6P435 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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