Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms