Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms