Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms