Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms