Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRMS1LQ5PSV4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms