Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms