Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms