Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms