Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q499Y3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q499Y3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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