Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF212Q495C1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms