Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EDRF1Q3B7T1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms