Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC57Q2TAC2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms