Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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