Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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