Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms