Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F4Q16254 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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