Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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