Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN9AQ15858 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN9AQ15858 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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