Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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