Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms