Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms